Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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