Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms