Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms