Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABCF2Q9UG63 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms