Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms