Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms