Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO5CQ9NQX4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms