Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms