Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms