Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-5Q9HDB9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK-5Q9HDB9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms