Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms