Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms