Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms