Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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