Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms