Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms