Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms