Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA5Q9BWX5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms