Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAGR1Q9BTK6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms