Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms