Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms