Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOPXQ9BPY8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms