Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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