Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIC2Q96JB3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms