Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB7BQ96AH8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms