Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA6Q92908 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms