Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms