Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC112Q8NEF3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms