Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms