Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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