Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms