Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms