Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms