Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms