Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms