Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SGO1Q5FBB7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGO1Q5FBB7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms