Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TDRD12Q587J7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms