Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPAT3Q53EU6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms