Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms