Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms