Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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