Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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IRF4Q15306 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms