Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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