Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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