Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms