Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GAPVD1Q14C86 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAPVD1Q14C86 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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