Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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