Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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