Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms