Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RPA4Q13156 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RPA4Q13156 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RPA4Q13156 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RPA4Q13156 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RPA4Q13156 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RPA4Q13156 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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